豪猪所属的啮齿目下，与其亲缘关系最近的动物主要存在于豪猪亚目中。该亚目包含多个科，具体近亲关系如下：

核心近亲：同属豪猪亚目的动物

• 美洲豪猪：与旧大陆豪猪（主要分布在亚洲、非洲、欧洲）同属豪猪亚目，但属于不同的科（新大陆豪猪属美洲豪猪科 Erethizontidae，旧大陆豪猪属豪猪科 Hystricidae）。它们在约3000万年前从共同祖先分化，是解剖学、行为学和遗传学上关系最近的现存群体。
• 河狸鼠：又称海狸鼠或草狸獭（Myocastor coypus），属于河狸鼠科（Myocastoridae）。该科是豪猪亚目中的单科单种，分子系统学研究表明其与豪猪科亲缘极近。
• 长尾豚鼠：属于长尾豚鼠科（Dinomyidae），现存种为棕长尾豚鼠（Dinomys branickii）。该科是豪猪亚目的一部分。
• 岩鼠：属于岩鼠科（Petromuridae），仅存岩鼠（Petromus typicus）。该科同样属于豪猪亚目。

重要近亲：同属非洲兽总目的啮齿动物

• 跳兔：或称蹄兔（Pedetes capensis），属于跳兔科（Pedetidae）。虽然有时被归类于独立的跳兔形亚目，但系统发育研究表明它们与豪猪亚目共同组成豪猪下目（Anomaluromorpha），是姐妹群关系。
• 滨鼠：包括多个属种（如裸鼹鼠），属于滨鼠科（Bathyergidae）。属于滨鼠下目（Bathyergomorpha），与豪猪亚目同属非洲啮形类分支。
• 蔗鼠：属于蔗鼠科（Thryonomyidae）。与滨鼠下目关系更近，同属非洲啮形类分支。

广义近亲：同属豪猪型小目的动物

• 豚鼠：天竺鼠及其近亲，属于豚鼠科（Cavidae）。
• 水豚：世界上最大的啮齿动物，属于水豚科（Hydrochoeridae）。
• 刺豚鼠：属于刺豚鼠科（Dasyproctidae）。
• 毛丝鼠：即龙猫，属于毛丝鼠科（Chinchillidae）。

这些动物与豪猪共同属于豪猪型小目（Caviomorpha），主要分布于南美洲，与旧大陆的豪猪亚目动物在大约4000万-5000万年前由共同祖先分化。

豪猪在现存动物中，最核心的近亲是同属豪猪亚目的美洲豪猪、河狸鼠、长尾豚鼠、岩鼠等。在更广泛的演化支上，跳兔、滨鼠、蔗鼠等非洲啮形类动物以及南美洲的豚鼠、水豚、刺豚鼠、毛丝鼠等同属啮齿目下的豪猪型下目或非洲啮形类分支。